Valmista shakshuka kuorimalla ja hienontamalla ensin sipuli ja valkosipulinkynnet. Kuullota sipuleita pari minuuttia öljyssä paistinpannulla. Lisää säilötyt kirsikkatomaatit, paseerattu tomaatti, huuhdottu pinaatti ja mausteet. Kypsennä viisi minuuttia. Maista ja mausta tarvittaessa lisää. Lisää pannulle kananmunat. Peitä pannu kannella tai alumiinifoliolla, kunnes kananmunat ovat hyytyneet. Murustele vielä shakshukan pinnalle Apetina-juustoa. Viimeistele shakshuka hienonnetuilla tuoreilla yrteillä.
Tarjoile shakshuka aamiaisella tai brunssilla tuoreen leivän kanssa.